Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6CQ53S08 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6CQ53S08 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms