Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RNF212Q495C1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF212Q495C1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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