Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSRP2Q16527 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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