Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms