Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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