Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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