Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPAQ15257 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPAQ15257 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPAQ15257 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPAQ15257 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPAQ15257 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTPAQ15257 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPAQ15257 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTPAQ15257 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPAQ15257 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PTPAQ15257 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PTPAQ15257 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PTPAQ15257 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PTPAQ15257 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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PTPAQ15257 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPAQ15257 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPAQ15257 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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