Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNIQ14094 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNIQ14094 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms