Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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