Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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