Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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