Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP140Q13342 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP140Q13342 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms