Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
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