Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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