Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms