Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms