Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms