Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms