Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms