Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms