Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms