Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCS1P62166 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCS1P62166 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCS1P62166 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms