Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP6P59044 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP6P59044 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms