Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX5P48382 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX5P48382 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX5P48382 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX5P48382 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX5P48382 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX5P48382 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX5P48382 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX5P48382 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX5P48382 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX5P48382 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX5P48382 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX5P48382 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX5P48382 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX5P48382 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX5P48382 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX5P48382 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX5P48382 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX5P48382 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX5P48382 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX5P48382 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX5P48382 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX5P48382 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX5P48382 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX5P48382 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms