Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPOP42166 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPOP42166 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPOP42166 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPOP42166 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms