Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms