Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms