Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA4P34932 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms