Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB2P29033 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB2P29033 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms