Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YY1P25490 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YY1P25490 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YY1P25490 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YY1P25490 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YY1P25490 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YY1P25490 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YY1P25490 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YY1P25490 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YY1P25490 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YY1P25490 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YY1P25490 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YY1P25490 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YY1P25490 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YY1P25490 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YY1P25490 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms