Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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