Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHV1-8P0DP01 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms