Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms