Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms