Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOBOXO60393 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms