Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms