Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

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Length 2,067 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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