Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms