Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB4A4D0S4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms