Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms