Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF7Q9UBF6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms