Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MBD5Q9P267 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms