Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms