Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMOD3Q9NYL9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms