Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms