Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms