Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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