Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms