Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms