Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms